Metabolomics

HMELAB

1.Untargeted Metabolomics
2.Targeted Metabolomics
3.Lipidomics Profiling

Metabolomics

Untargeted Metabolomics

Untargeted metabolomics(비표적 대사체 분석)은 시료 내 존재하는 모든 대사체를 포괄적으로 탐색하여, 알려진 물질뿐 아니라 아직 규명되지 않은 대사체까지 동시에 분석하는 접근법입니다. 특정 물질에 초점을 맞추지 않기 때문에, 시료의 대사 전반적 변화를 관찰하거나 새로운 바이오마커를 발굴하는 데 매우 유용합니다. 일반적으로 LC-MS(액체 크로마토그래피-질량분석), GC-MS(기체 크로마토그래피-질량분석) 등이 사용되며, 얻어진 데이터는 통계적·생물정보학적 기법을 통해 대사경로 분석 및 생리적 의미 해석에 활용됩니다.

Service Features
Sample Type Water/Organic solvent soluble materials
Analyser Waters C18, HILIC and Q Exactive HFX, HF, QTRAP 6500+
Turnaround Time ~6 weeks after sample QC
Service Workflow
Data Analysis

Untargeted metabolomics는 다양한 생명과학 및 의학 연구 분야에서 폭넓게 활용됩니다. 우선 질병 분야에서는 대사체 프로파일의 변화를 통해 암, 당뇨, 신경퇴행성 질환, 심혈관 질환 등의 조기 진단 및 바이오마커 발굴에 사용되며, 약물학 분야에서는 약물의 대사 경로를 파악하고 부작용이나 약물 반응성을 평가하는 데 기여합니다. 미생물학 및 환경생물학에서는 미생물 간 상호작용이나 환경 스트레스에 따른 대사 변화 분석, 식품 분야에서는 식품 품질 평가, 발효 과정 모니터링, 영양소 대사 이해 등에 활용됩니다.

Standard:
1.1 Data Processing
01
Peak extraction
02
Peak alignment
03
Metabolite identification
04
Missing value filling
05
Normalization
06
Low quality data filtering
1.2 Data Quality Control
01
BPC overlapping diagram of QC samples
02
PCA analysis of QC samples and real samples
03
CV distribution of metabolites in QC samples
1.3 Annotation of Metabolites
01
Classification and annotation of metabolites
02
Pathway annotation of metabolites
1.4 Statistical Analysis and Screening of Differential Metabolites
01
Univariate analysis (fold change and T test)
02
Multivariate analysis (PCA, PLS-DA, OPLS-DA)
03
Screening of differential metabolites
1.5 Cluster Analysis and Correlation Analysis of Differential Metabolites
1.6 Enrichment Analysis of Metabolic Pathways of Differential Metabolites
Demo Results
BPC Overlay of QC Samples
BPC Overlay of QC Samples
PCA Analysis
PCA Analysis
CV Distribution
CV Distribution
Metabolite Classification Bar Chart
Metabolite Classification Bar Chart
KEGG Function Comment Bar Chart
KEGG Function Comment Bar Chart
Score Graph of PLS-DA
Score Graph of PLS-DA
Volcano Plot
Volcano Plot
Cluster Analysis
Cluster Analysis
ROC Curve
ROC Curve
Metabolite Correlation Analysis
Metabolite Correlation Analysis
KEGG Metabolic Pathway
KEGG Metabolic Pathway

Metabolomics

Targeted Metabolomics

Targeted metabolomics(표적 대사체 분석)은 미리 선정된 특정 대사체나 대사 경로에 속한 물질들만을 정량적으로 분석하는 접근법입니다. 이 방법은 표적 물질의 농도를 높은 민감도와 정확도로 측정할 수 있어, 생리적 변화나 병리적 상태와 관련된 대사 경로의 구체적 조절 메커니즘을 규명하는 데 적합합니다. 주로 LC-MS/MS(액체 크로마토그래피-이중 질량분석기)나 GC-MS를 이용하며, 내부표준물질을 사용하여 절대정량을 수행합니다.

Service Features
Sample Type Water/Organic solvent soluble materials
Analyser Waters C18, HILIC and Q Exactive HFX, HF, QTRAP 6500+
Turnaround Time ~6 weeks after sample QC
Service Workflow
Data Analysis

Targeted Metabolomics는 질병 진단용 바이오마커 검증, 약물 대사 연구, 영양 및 식이효과 평가, 미생물 또는 세포 대사경로 규명, 품질관리 및 임상대사체 모니터링 등에 활용됩니다. 특히, targeted metabolomics로 발굴된 후 대사체를 검증하거나 특정 대사경로의 기능적 의미를 확인하는 데 필수적인 후속 단계로 활용됩니다.

Category of Targeted Metabolites
Category of targeted metabolites Number of metabolites
Amino acid20
Water-soluble vitamin5
Fat-soluble vitamin5
Steroid hormone12
Bile acid45
Trimethylamine oxide4
Short-chain fatty acids7
Neurotransmitter39
Trace elements and heavy metals18
Homocysteine metabolism9
Plant hormone32
Tryptophan metabolism29
Demo Results
Score graph of PLS-DA
Score graph of PLS-DA
Volcano plot
Volcano plot
Cluster analysis
Cluster analysis
ROC curve
ROC curve
Metabolite correlation analysis
Metabolite correlation analysis
KEGG metabolic pathway
KEGG metabolic pathway
Differential metabolite clusterin
Differential metabolite clusterin
Metabolites donut chart
Metabolites donut chart
Correlation chord diagrams on differential metabolites
Correlation chord diagrams on differential metabolites

Metabolomics

Lipidomics Profiling

Lipidomics는 생체 내 모든 지질 분자를 포괄적으로 분석하여 지질 조성, 구조, 대사 변화를 규명하는 오믹스 기술입니다. 이 기술의 주요 특징은 질량분석기(Mass Spectrometry, MS)와 액체크로마토그래피(LC)를 결합하여 극성 및 비극성 지질을 고해상도로 구분·정량할 수 있다는 점이며, 복잡한 지질 네트워크와 세포막 구조, 신호전달 경로의 변화를 동시에 추적할 수 있습니다. 장점으로는 지질 대사의 미세한 변화를 감지하여 질병 바이오마커 발굴이나, 대사경로 수준에서 병태생리를 규명할 수 있다는 점이 있습니다.

Service Features
Sample Type Cells, Lysates, Tissues, Biofluids, Microbial samples, Organelles, and Extracellular vesicles, Plant and others
Analyser Orbitrap, Q Exactive HF/HFX, Exploris, Waters ACQUITY UPLC
Turnaround Time ~6 weeks after sample QC
Service Workflow
Data Analysis

Lipidomics는 생체 내 다양한 지질 분자를 포괄적으로 분석하여 지질 대사 네트워크와 세포 기능 변화를 정량적으로 규명하는 기술입니다. 이 접근법은 질병분석, 신경퇴행성 질환, 암, 심혈관 질환 등에서 지질 조성 변화를 밝혀 관련 바이오마커를 발굴하는데 활용되며, 환경 및 식품 분야에서도 응용됩니다.

Standard Analysis
1.1 Data Processing
01
Peak extraction
02
Peak alignment
03
Lipid identification
04
Missing value filling
05
Normalization
06
Low quality data filtering
1.2 Data Quality Control
01
BPC overlapping diagram of QC samples
02
PCA analysis of QC samples and real samples
03
CV distribution of metabolites in QC samples
1.3 Statistical and Relative Quantitative Analysis of Lipid Classes
1.4 Statistical Analysis and Screening of Differential Lipids
01
Univariate analysis (fold change and T test)
02
Multivariate analysis (PCA, PLS-DA, OPLS-DA)
03
Screening of differential lipids
1.5 Differential Lipid Analysis
01
Volcano Plot
02
Clustering heat map
03
Lipid correlation analysis
Customized Analysis

16S/Metagenome+Lipidome Correlation Analysis
Transcriptome+Lipidome Correlation Analysis
Proteome+Lipidome Correlation Analysis

Demo Results
BPC Overlay of QC Samples
BPC Overlay of QC Samples
PCA Analysis
PCA Analysis
CV Distribution
CV Distribution
Statistical Chart of Lipid Sub Classes
Statistical Chart of Lipid Sub Classes
Total Lipid Molecule Content Change by Category Level
Total Lipid Molecule Content Change by Category Level
Score Graph of PLS-DA
Score Graph of PLS-DA
Volcano Plot
Volcano Plot
Cluster Analysis
Cluster Analysis
ROC Curve
ROC Curve
Lipid Correlation Analysis
Lipid Correlation Analysis